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氟硼二吡咯化合物(4,4-difluoro-boradiazaindacene，簡稱BODIPY)類熒光染料是非常優秀的新興染料之一。左右兩個吡咯環由一個甲川橋鍵連接、中間有一個硼氮六元雜環，三個環呈非常好的剛性共軛平面結構，與硼原子連接的兩個氟原子位于BODIPY核心平面的兩端。

BODIPY類熒光染料有著光化學物理性能，主要有以下幾點：
(1)有很高的摩爾消光系數，對染料光敏性能的提高有利。
(2)有較高的熒光量子產率，一般可達0.6以上，許多染料的量子產率可達到1。在溶液中仍然保持很高的量子產率，不會發生淬滅現象，可應用于生物分析領域。
(3)染料的光譜性質相當穩定，不易受溶劑極性和pH值的影響。可應用于生物分子標記如 DNA領域。
(4)染料的熒光光譜峰寬較小,這個優點使得染料在應用到分析領域的時候檢測靈敏度更高。
(5染料具有較好的光熱穩定性和化學穩定性，避免受外界干擾而迅速光降解,保證了光信號的穩定。

aza-BODIPY-Br2
Aza-BODIPY氮雜氟硼二吡咯
BDP-493/503-alkyne
BDP-493/503-amine
BDP-493/503-azide
BDP-493/503-carboxylic acid
BDP-493/503-DBCO
BDP-493/503-hydrazide
BDP-493/503-maleimide
BDP-493/503-NHS ester
BDP-493/503-tetrazine
BDP-530/550-alkyne
BDP-530/550-amine
BDP-530/550-azide
BDP-530/550-carboxylic acid
BDP-530/550-DBCO
BDP-530/550-hydrazide
BDP-530/550-maleimide
BDP-530/550-NHS ester
BDP-530/550-tetrazine
BDP-558/568-alkyne
BDP-558/568-amine
BDP-558/568-azide
BDP-558/568-carboxylic acid
BDP-558/568-DBCO
BDP-558/568-hydrazide
BDP-558/568-maleimide
BDP-558/568-NHS ester
BDP-558/568-tetrazine
BDP-564/570-alkyne
BDP-564/570-amine
BDP-564/570-azide
BDP-564/570-carboxylic acid
BDP-564/570-DBCO
BDP-564/570-hydrazide
BDP-564/570-maleimide
BDP-564/570-NHS ester